Колледж ведет свою историю от Мурманского техникума механизации учета, созданного в 1977 году приказом ЦСУ РСФСР от 27 апреля 1977 г. №169. В 1977г. был произведен первый набор по 2 специальностям:
- бухгалтерский учет;
- механизация учета и вычислительных работ.
Инициатором открытия техникума и его первым директором был Саминский Лев Михайлович. Первоначально техникум размещался в приспособленном здании на ул Тарана д.25. Были трудности: не хватало аудиторий, буфет в подвале. Первым выпускникам дипломы вручались в коридоре второго этажа. В 1979 году началось строительство нового здания для техникума по адресу Полярные Зори д.60 и в следующем году техникум переехал в новое здание.
В течение 35 лет учебное заведение неоднократно меняло ведомственную принадлежность и названия.   В 1990 году техникум был переименован в «Мурманский техникум информатики и вычислительной техники» (Приказ Госкомстата РСФСР от 18.07.1990г. за № 123). 
В соответствии с Приказом Госкомстата России от 28.08.1996г. за № 195 на базе Мурманского техникума информатики и вычислительной техники Госкомстата России создан его правопреемник «Мурманский колледж экономики, статистики и информатики».
Распоряжением Правительства Российской Федерации от 28.06.2002г. № 883-р Мурманский колледж экономики, статистики и информатики был передан в ведение Министерства образования Российской Федерации.
С января 2012г. колледж передан в ведение Мурманской области. 30.11.2012 Губернатором Мурманской области  подписано распоряжение Правительства Мурманской области № 413-РП "О создании государственных автономных образовательных учреждений Мурманской области среднего профессионального образования..." в соответствии с которым с 01.01.2013 государственное бюджетное образовательное учреждение Мурманской области среднего профессионального образования "Мурманский колледж экономики и информационных технологий" изменяет тип и становится государственным автономным образовательным учреждением Мурманской области среднего профессионального образования "Мурманский колледж экономики и информационных технологий.
С 01.09.2014 в результате реорганизации к колледжу присоединен ГАОУ МО СПО "Мурманский торгово-экономический колледж" и колледж сменил название на Государственное автономное профессиональное образовательное учреждение "Мурманский колледж экономики и информационных технологий".
К государственной аттестации представлены специальности среднего профессионального образования базового уровня:
09.02.07 Информационные системы и программирование

10.02.05 Обеспечение информационной безопасности автоматизированных систем

38.02.01 Экономика и бухгалтерский учет

38.02.04 Коммерция (по отраслям)

38.02.07 Банковское дело

43.02.01 Организация обслуживания в общественном питании

43.02.15 Поварское и кондитерское дело